Penerimaan Peserta Didik Baru (PPDB) bagi sebuah satuan pendidikan merupakan kegiatan yang amat penting dan mempunyai nilai strategis untuk menjaring calon peserta didik yang berpotensi. Demikian juga bagi Ma’had Madrasah (Islamic Boarding School) MTsN 31 Jakarta, proses PPDB dijadikan strategi awal dalam menjaring calon peserta didik yang berpotensi dan dapat mengikuti kegiatan pembelajaran secara optimal ditinjau dari sisi akademik, kepribadian, keimanan, dan memiliki kesungguhan sehingga diharapkan mereka dapat belajar dan bersosialisasi baik di ma’had maupun di madrasah.
Penerimaan Peserta Didik Baru Ma’had Madrasah (Islamic Boarding School) MTsN 31 Jakarta tahun pelajaran 2016/2017 diharapkan dapat menjaring siswa yang berpotensi, yang dapat dilihat dari beberapa indikator: potensi dasar siswa, kemampuan verbal, kemampuan numerik, kemampuan analitis, kemampuan menyerap informasi, kemampuan adaptasi, daya juang, dan kepribadian yang baik serta tes akademik yang meliputi tes bidang studi: Matematika, IPA, bahasa Inggris, Pendidikan Agama Islam, dan baca tulis al-Qur’an.
Calon Peserta Didik Baru berasal dari MI dan SD Negeri maupun Swasta. Indikator kelulusan lebih menekankan pada akademik dan potensi bakat skolastik. Dengan demikian, diharapkan kualitas input dapat memenuhi standar yang ditetapkan.